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    • 猕猴桃几丁质酶基因家族的鉴定和表达特征分析

      2025, 33(1):1-14.DOI: 10.11926/jtsb.4856

      关键词:几丁质酶猕猴桃基因鉴定基因表达
      摘要 (66)HTML (68)PDF 4.73 M (100)收藏

      摘要:为探究几丁质酶基因家族(CHis)的特征和功能,从猕猴桃(Actinidia chinensis)中鉴定得到18个AcCHis基因。系统进化分析表明它们分别聚在GH18和GH19分支,可分为6小组,组内各成员间的保守结构域、基因结构、蛋白质结构具有较高的相似性。AcCHis基因启动子区域的顺式作用元件主要涉及激素响应、非生物胁迫应答和生长发育调控。18个AcCHis基因不均匀分布在12条染色体上,其中有5个基因发生了片段重复。AcCHis的表达可能受到miR172、miR408调控。AcCHis中,GH18与GH19成员在不同组织(成熟果、幼果、叶、茎、花)中的转录差异明显。在猕猴桃果实贮藏过程中,90.9%的GH18成员不表达或表达量较低;而71.4%的GH19成员呈现差异表达,其中猕猴桃果实中AcCHi8在25℃贮藏1周和4℃贮藏1~3周均上调表达,以4 ℃贮藏3周的表达量最大(为对照的188倍),而果实浸泡ABA后在25 ℃贮藏1周的表达下调,推测AcCHis基因可能参与采后果实贮藏软化过程。

    • 橄榄ISSR和RAPD遗传多样性分析和核心种质构建

      2022, 30(1):41-53.DOI: 10.11926/jtsb.4437

      关键词:橄榄遗传多样性核心种质ISSRRAPD
      摘要 (297)HTML (644)PDF 1.31 M (4300)收藏

      摘要:为揭示中国橄榄(Canarium album)种质资源的遗传多样性,采用ISSR和RAPD标记对橄榄主要分布区的86份种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质。结果表明,基于UPGMA遗传相似系数,86份种质资源可分为3个大类;基于STRUCTURE模型聚类,可分为4个类群,这基本符合橄榄的地域性分布规律。采用ISSR和RAPD获得的中国橄榄种质资源的整体遗传多样性水平分别为0.284±0.169和0.244±0.163,多态性位点百分率分别为92.56%和100%,总遗传分化系数分别为0.127和0.142,基因流分别为3.423和3.025,群体间遗传相似系数分别为0.930和0.939,个体间遗传相似系数分别为0.736和0.732。因此,中国橄榄种质资源丰富的遗传多样性主要来源于个体间的遗传分化或变异,且这种遗传多样性存在明显的地域性差异。

    • 猕猴桃POD基因的克隆和表达分析

      2019, 27(1):11-18.DOI: 10.11926/jtsb.3919

      关键词:猕猴桃过氧化物酶果实软化低温脱落酸
      摘要 (923)HTML (358)PDF 954.53 K (928)收藏

      摘要:为了解猕猴桃POD基因的表达调控功能,采用RT-PCR技术从‘米良1号’猕猴桃(Actinidia deliciosa ‘Miliang-1’)克隆了2个POD家族成员基因(AdPOD27和AdPOD64)。结果表明,AdPOD27和AdPOD64开放阅读框分别为984和957 bp,预测分别编码327和318个氨基酸,GenBank登录号分别为MF774100和MF774101。AdPOD27和AdPOD64为亲水性碱性蛋白,属于植物亚铁红素依赖Ⅲ型POD超家族成员,含有信号肽、跨膜螺旋结构和磷酸化位点,亚细胞定位预测分别定位于线粒体和细胞外。qRT-PCR结果表明,AdPOD27在脱落酸(ABA)和4℃处理时表达量急剧上升,而AdPOD64只在ABA处理时表达量显著提高。此外,AdPOD27表达量与POD活性、AdPOD64表达量均存在显著相关性。因此,AdPOD27和AdPOD64可能在猕猴桃果实软化、低温响应和ABA诱导等过程中发挥重要的调控功能。

    • 橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析

      2018, 26(6):571-579.DOI: 10.11926/jtsb.3877

      关键词:橄榄抗寒转录因子ICE1克隆基因表达
      摘要 (1106)HTML (408)PDF 1.24 M (1131)收藏

      摘要:为了解橄榄(Canarium album)抗寒相关转录因子ICE1的调控功能,采用RT-PCR技术克隆了‘福榄1号’的ICE1,命名为CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析。结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1 650 bp,可编码549个氨基酸(GenBank登录号MG459422)。CaICE1为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域,定位于细胞核,与枳的ICE1亲缘关系较近。CaICE1密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群。CaICE1主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下CaICE1表达水平比常温显著上升。psRNAtarget预测结果表明,CaICE1可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因。因此,CaICE1可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受miRNA的调控。

    • 龙眼体胚CDC48基因的克隆、原核表达及其在体胚发生过程中的表达分析

      2014, 22(3):233-241.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2014.03.004

      关键词:龙眼体细胞胚胎发生CDC48 基因生物信息学
      摘要 (2261)HTML (0)PDF 2.96 M (2395)收藏

      摘要:为探讨龙眼(Dimocarpus longan)体胚CDC48 基因的表达方式,采用RT-PCR 和RACE 方法,从龙眼胚性愈伤组织中克隆得到1 条长度为2620 bp、含有完整开放阅读框的DlCDC48 基因cDNA 序列(GenBank 登录号:EU606206)和长度为2418 bp 的DNA 序列(GenBank 登录号:FJ590953)。DlCDC48 编码1 个含有805 个氨基酸的蛋白质。DlCDC48 基因不含内含子。生物信息学分析表明:DlCDC48 蛋白为不具跨膜结构域的亲水性胞质蛋白,不具有信号肽,定位在细胞核;与其他植物的CDC48 有较高的同源性。将DlCDC48 基因构建成原核表达载体,经IPTG 诱导表达了1 个分子量约为89 kD 的蛋白。利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术,DlCDC48 在龙眼体胚发育过程中的各个阶段均有表达,其中球形胚时的表达量最低,胚性紧实球形结构阶段的表达量最高。这为进一步研究CDC48 基因在植物体胚发生中的作用奠定基础。

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