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    • 菱叶绣线菊彩叶园艺品种‘粉霜’和‘黄金喷泉’的叶绿体基因组研究

      2023, 31(4):510-520.DOI: 10.11926/jtsb.4769

      关键词:绣线菊属园艺品种叶绿体基因组系统发育分析
      摘要 (177)HTML (395)PDF 972.75 K (596)收藏

      摘要:基于菱叶绣线菊(Spiraea×vanhouttei)培育出了很多的彩叶园艺品种,其中‘粉霜’彩叶绣线菊(‘Pink Ice’)和‘黄金喷泉’菱叶绣线菊(‘Gold Fountain’)是两个性状优良的品种,这两个彩叶品种的形成机制尚缺乏深入研究。该研究基于二代测序的浅层测序技术,对‘粉霜’和‘黄金喷泉’的叶绿体基因组进行组装、注释、绘制其叶绿体基因组图谱;结合网上已有的绣线菊属植物的叶绿体全基因组开展比较基因组学研究。结果表明,两个品种的叶绿体基因组均为典型的四分体结构,即含有1个LSC、1个SSC及2个IR;‘粉霜’和‘黄金喷泉’的叶绿体基因组大小分别为155 953和155 941 bp,各含有130个基因,包括85个蛋白编码基因,37个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因;分别含有67、69个简单重复序列,其中,单核苷酸重复序列最多。筛选出这两个叶绿体基因组内7个高变异区域,分别为trnH_GUG-psbA、trnK_UUU、trnR_UCU-atpA、trnT_ GCU-psbD、ndhC、rpl32、ycf1。菱叶绣线菊、‘粉霜’和‘黄金喷泉’虽有非常近缘的关系,但并未聚成单系。该研究首次获得了两种绣线菊属彩叶品种的叶绿体基因组,为进一步理解绣线菊属及其彩叶园艺品种的亲缘关系提供了大量有用信息,并为今后该属更多园艺资源的发掘奠定了基础。

    • 金边红苞凤梨叶片的超微观察和AbGLK1的克隆与表达分析

      2022, 30(3):311-320.DOI: 10.11926/jtsb.4479

      关键词:金边红苞凤梨叶绿体超微结构AbGLK1基因克隆转录激活活性基因表达
      摘要 (211)HTML (594)PDF 7.89 M (564)收藏

      摘要:为了解Golden2-like (GLK)转录因子在金边红苞凤梨(Ananas comosus var. bracteatus ‘Chiyan’)绿白嵌合叶片形成中的作用,采用RT-PCR技术克隆得到了AbGLK1基因, 其开放阅读框全长1 371 bp,编码456个氨基酸,含有1个GARP-DNA结合域和1个C末端结构域GCT box (GOLDEN2 C-terminal box),属于GLK转录因子家族,在酵母中具有转录因子的转录激活活性。烟草亚细胞定位表明AbGLK1蛋白定位在细胞核。RT-qPCR分析表明,AbGLK1基因在金边红苞凤梨的根、茎、叶中均有表达,但具有组织器官差异性,在叶片中的表达量显著高于根和茎(P < 0.05)。AbGLK1基因在叶片边缘白化组织中的表达量显著低于绿色组织,约为绿色组织的1/3 (P < 0.05)。叶片白化组织叶绿体内膜系统模糊,无类囊体存在,含有大量囊状小泡,质体小球数量多且体积较大。因此,推测AbGLK1基因可能参与了金边红苞凤梨中的叶绿体发育,其下调表达可能导致叶片白化组织中叶绿体发育不成熟。

    • 滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析

      2022, 30(3):336-348.DOI: 10.11926/jtsb.4472

      关键词:滇黄精叶绿体基因组密码子使用偏性最优密码子
      摘要 (335)HTML (671)PDF 2.18 M (416)收藏

      摘要:为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。结果表明,滇黄精完整叶绿体基因组长度为155 852 bp,基因组平均GC含量为37.7%,其大、小单拷贝区(LSC)长度分别为84 633和185 25 bp,反向重复区长度为26 347 bp,注释了132个基因,包括86个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个核糖rRNA基因。叶绿体基因组中共有69个SSR位点,绝大多数属于单碱基重复的A/T类型。系统发育分析表明滇黄精与格脉黄精(P. tessellatum)亲缘关系近,可能与分布地域有关。密码子偏好性分析表明,滇黄精叶绿体基因组密码子使用模式受到自然选择影响大于突变因素,最终确定9个最优密码子。因此, 滇黄精叶绿体基因组遗传结构和系统发育位置及其密码子偏倚的分析,为叶绿体基因工程研究提供理论依据。

    • 药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究

      2015, 23(6):601-613.DOI: 10.11926/j.issn.1005-3395.2015.06.001

      关键词:叶绿体全基因组华重楼黑药花科百合目cemA假基因化
      摘要 (2471)HTML (0)PDF 4.31 M (2333)收藏

      摘要:为探究华重楼(Paris polyphylla var. chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp,由4个区组成,包括2个反向重复区(IRA和IRB,27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC,18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC,85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因,包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4 个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cemA基因是假基因,其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列,编码序列中出现多个终止密码子, 且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此,华重楼叶绿体基因组比较保守;cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息,其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。

    • 竹子叶绿体基因组SSR分子标记的开发及其应用

      2014, 22(3):263-269.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2014.03.008

      关键词:竹子叶绿体SSR异质性
      摘要 (2176)HTML (0)PDF 832.72 K (3224)收藏

      摘要:为探讨观赏竹叶片异质性的机理,根据麻竹(Dendrocalamus latiflorus)和绿竹(Bambusa oldhamii)叶绿体基因组序列开发SSR 分子标记。结果表明,在麻竹和绿竹叶绿体基因组中分别存在87 和86 个SSR 位点,其中三核苷酸重复类型最多,其次为单核苷酸重复类型。根据SSR 位点设计21 对引物,其中11 对引物对6 竹种能够扩增出稳定、清晰的条带,且具有多态性,引物有效率达到52.4%。聚类分析表明,6 竹种可分为两大类群,与形态学分类结果基本一致。有4 对引物在菲白竹(Pleioblastusfortunei)和白纹椎谷笹(Sasaella glabra f. albo-striata)的花叶中具有多态性,可作为区分观赏竹叶片异质性的分子标记。

    • 薯瘟菌对甘薯叶片光合特性及叶绿体结构的影响

      2014, 22(6):610-616.DOI: 10.11926/j.issn.1005-3395.2014.06.009

      关键词:甘薯薯瘟菌叶片细胞膜透性叶绿体光合特性
      摘要 (2170)HTML (0)PDF 4.75 M (2856)收藏

      摘要:为探讨甘薯(Dioscorea esculenta)被薯瘟菌(Ralstonia solanacearum)侵染后的响应,以抗病品种‘湘薯75-55和感病品种‘胜利百号为材料,对甘薯叶片的光合特性和叶绿体结构进行了研究。结果表明,薯瘟菌侵染后,‘胜利百号叶片的细胞膜透性(MP)明显增大,叶绿素(Chl)含量下降,净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)和气孔导度(Gs)下降,胞间二氧化碳浓度(Ci)和内源ABA 含量急剧升高,且细胞膜完整性被破坏,叶绿体数目减少、膨胀模糊、基粒片层松散解体以及淀粉粒变小;而‘湘薯75-55的各个指标变化不大,细胞膜结构完整,叶绿体基粒片层排列整齐。因此,薯瘟菌侵染后不同抗病品种甘薯叶片在光合特性和叶绿体结构上表现出显著的差异。

    • 基于叶绿体DNA atpB-rbcL区序列探讨石蒜属种间系统发育关系

      2013, 21(2):109-115.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2013.02.002

      关键词:石蒜属叶绿体atpB-rbcL序列种间系统发育关系杂交起源系统发育树
      摘要 (2519)HTML (0)PDF 1.21 M (3567)收藏

      摘要:为了探讨石蒜属(Lycoris Herb.)植物的种间系统发育关系,对石蒜属植物95 份材料,包括15种4变种及2个人工杂种的叶绿体DNA atpB-rbcL间隔区进行了测序,结合花部形态和核型特征,探讨了石蒜属种间系统关系及其可能的杂交起源。系统发育树的分析结果表明,矮小石蒜(L. radiata var. pumila)和换锦花(L. sprengeri)与2个人工杂交种、麦秆石蒜(L. straminea)、江苏石蒜(L. houdyshelii)、短蕊石蒜(L. caldwellii)和乳白石蒜(L. albiflora)具有密切的亲缘关系。atpB-rbcL序列揭示的石蒜属种间关系与染色体核型的分类结果部分一致,主要表现在具有近端部着丝粒(A)染色体的种与具有中部(M)和端部(T)着丝粒染色体的种各成一支,与形态和染色体分类结果一致;不同之处在于具有中部、端部和近端部着丝粒染色体的种分散在两个主要分支内,进一步验证了具有中部、端部和近端部3 种着丝粒类型染色体组的石蒜,如麦秆石蒜、江苏石蒜、短蕊石蒜和乳白石蒜等,是杂交起源的假设,结合2 个人工杂交种分析,揭示了短蕊石蒜和乳白石蒜的近端部着丝粒染色体来源于换锦花;麦秆石蒜和江苏石蒜近端部着丝粒染色体来源于矮小石蒜。

    • 叶绿体转化三角褐指藻表达外源蛋白

      2011, 19(3):267-272.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2011.03.012

      关键词:三角褐指藻;叶绿体转化;同源重组;电穿孔
      摘要 (4443)HTML (0)PDF 5.35 M (2671)收藏

      摘要:为建立三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)叶绿体表达体系,从其叶绿体基因组中克隆了rns-trnI、trnA-rnl序列作为遗传转化同源重组序列,并以氯霉素抗性基因(CAT)表达盒作为筛选标记,以及绿色荧光蛋白基因(GFP)表达盒作为报告基因。以TA克隆载体pMD19-T为基础,将CAT表达盒以及GFP表达盒连接到rns-trnI /trnA-rnl两个同源重组片段之间,构建得到含有报告基因GFP表达盒的三角褐指藻叶绿体表达载体,利用电穿孔法将载体导入三角褐指藻叶绿体。对转化藻进行抗性筛选以及报告基因的检测,结果表明,外源基因CAT在转化藻中得到表达并提供抗性, 报告基因GFP成功地在叶绿体中表达。

    • 镧对辣根叶净光合速率和细胞超微结构的影响

      2007, 15(2):121-125.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2007.2.005

      关键词: 辣根 叶绿体 超微结构 叶绿素;光合作用
      摘要 (2574)HTML (0)PDF 0.00 Byte (2063)收藏

      摘要:测定了用稀土镧[La(Ⅲ)] 处理过的辣根(Armoracia rusticana)叶片净光合速率(Pn)和叶绿素(Chl)含量, 并用透射电镜观察了经La(Ⅲ)处理后辣根叶绿体超微结构的变化。 结果表明, 30 mg L-1 La(Ⅲ)处理24 h, Pn和Chl含量较对照分别提高0.82%、3.69%, 对应的超微细胞结构无明显变化; 48 h处理则抑制辣根光合作用, 细胞结构变化明显,类囊体基粒片层垛叠变薄, 结构松散。而60 mg L-1 La(Ⅲ) 24h、48h处理对辣根的生理和结构均有明显的抑制和破坏,且时间越长破坏越严重。对Pn和Chl含量进行处理时间、稀土浓度及两者共同作用多因素方差分析得出, 处理时间对Chl含量的影响不显著, 但对Pn的影响极显著,且稀土浓度及二者的共同作用对Pn和Chl含量均达到极显著影响。

    • 光氧化条件下碳代谢中间产物与光合电子传递对PSⅡ光化学活性的调节作用

      2005, 13(1):1-7.DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2005.1.001

      关键词:菠菜叶绿体; 光氧化; PSⅡ活性; 碳代谢中间产物; 电子传递
      摘要 (2440)HTML (0)PDF 0.00 Byte (3208)收藏

      摘要:在MV和强光的光氧化条件下研究外加光合碳代谢中间产物、光呼吸C2酸和光合电子传递抑制剂等对菠菜叶绿体PSⅡ光化学活性的调节作用。结果表明,光氧化条件下外加“RuBP再生系统”和乙醇酸钠可提高qP和ΦPSⅡ,而R5P、DHAP和HCO3-可提高qN,显示其对光氧化下叶绿体PSⅡ活性有一定程度的保护作用。其他外加化合物3-PGA、3-GAP、HPMS、DCMU、DBMIB、Ant A、短杆菌肽D等则对以叶绿素荧光参数表示的光化学活性和氧电极测定的全链电子传递速率表现抑制效应。据此认为在叶绿体水平上阻断或改变光合电子流的流向,更改光合碳还原和光呼吸代谢物浓度,皆可直接或间接影响光氧化下PSⅡ的光化学活性,其作用因不同化合物而异。

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